Track Record:

2026

Article

• "NVL2-interacting protein CWF19L2 is required for debranching of intron-derived lariat RNAs"
  Oshima R, Izumikawa K, Yamazaki R, Iwakawa Y, Tamura M, Shida T, Miyao S, Nagahama M
  Biochemical and Biophysical Research Communications Volume 796, 153160 (2026).

  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2025.153160

2025

Article

• "Molecular basis of the autoregulatory mechanism of motor neuron-related splicing factor 30"
  Izumikawa K*, Shida T*, Onodera Y, Tashima, Miyao S, Suda T, Suda Y, Kamimura R, Nagai M, Sugihara M, Noguchi T, Nagahama M. (*Equal contribution)
  Journal of Biological Chemistry 301:110522. (2025).

  • DOI: 10.1016/j.jbc.2025.110522
• "Data for proteomic analysis of the chaperone-like nuclear VCP-like 2 (NVL2)-associated proteins."
  Izumikawa K, Nobe Y, Taoka M, Nagahama M.
  Journal of Proteome Data and Methods Volume 7, 1- (2025).

  • DOI: 10.14889/jpdm.2025.0001
• "Dual synthesis pathways of scaRNA28 via intronic processing of transformation/transcription domain-associated protein transcripts and a novel independent transcription unit"
  Izumikawa K, Shida T, Ishikawa H, Miyao S, Ohga T, Taoka M, Nobe Y, Nakayama H, Nagahama M.
  RNA biology 22(1):1-12. (2025).

  • DOI: 10.1080/15476286.2025.2513133
• "Molecular basis of the autoregulatory mechanism of motor neuron-related splicing factor 30"
  Izumikawa K, Shida T, Onodera Y, Tashima, Miyao S, Suda T, Suda Y, Sugihara M, Noguchi T, Nagahama M.
  bioRxiv (Preprint) (2025).

  • DOI: 10.1101/2025.03.04.641417
• "SLFN11-mediated ribosome biogenesis impairment induces TP53-independent apoptosis."
  Ogawa A*, Izumikawa K*, Tate S*, Isoyama S, Mori M, Fujiwara K, Watanabe S, Ohga T, Jo U, Taniyama D, Kitajima S, Tanaka S, Onji H, Kageyama S, Yamamoto G, Saito H, Morita YT, Okada M, Natsumeda M, Nagahama M, Murai J. (*Equal contribution)
  Molecular Cell 85, 5 (2025).

  • URL
  • DOI: 10.1016/j.molcel.2025.01.008

Conference (Oral presentation)

• "Histone homeostasis mechanisms preventing chromatin gaps and the effects of their collapse"
  Keiichi Izumikawa, Tatsuya Shida, Masami Nagahama
  第48回 分子生物学会年会 ミニシンポジウム「スキマの分子生物学」 (2025).
• "AAA-ATPase NVL2 のリボソーム生合成における機能とその欠損により誘導される核小体ストレス応答の解析"
  田村 正則、野本 雅裕、廣岡 侑也、泉川 桂一、長浜 正巳
  第24回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2025 (2025).
• "MTR4-RNA エキソソームと相互作用するタンパク質 SPF30の U6 snRNA 代謝機構への関与 "
  小野寺 優花、田嶋 唯人、泉川 桂一、長浜 正巳
  第24回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム 2025 (2025).
• "RNA エキソソーム関連因子 SPF30 の自己発現制御機構の分子基盤解明"
  志田 達哉、小野寺 優花、田嶋 唯人、杉原 稔、野口 保、泉川 桂一、長浜 正巳
  第24回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2025 (2025).
• "ラリアット型イントロン RNA デブランチング反応に関わる新規タンパク質 CWF19L2 の機能解析"
  大島 廉太、山崎 隆蔵、泉川 桂一、長浜 正巳
  第24回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2025 (2025).

Conference (Poster presentation)

• "RNAエキソソーム結合タンパク質SPF30によるU6 snRNA代謝制御機構の解析 "
  小野寺 優花、田嶋 唯人、志田 達哉、泉川 桂一、長浜 正巳
  第98回 日本生化学会大会 (2025).
• "AAA-ATPase NVL2の欠損に起因するリボソーム生合成障害と核小体ストレス応答の解析 "
  田村 正則、野本 雅裕、元永 沙由里、廣岡 侑也、泉川 桂一、長浜 正巳
  第98回 日本生化学会大会 (2025).
• "シャペロン様AAA-ATPase NVL2の欠損に起因するリボソーム生合成障害と核小体ストレス応答の誘導 "
  野本 雅裕、泉川 桂一、田村 正則、元永 沙由里、廣岡 侑也、長浜 正巳
  第25回 日本蛋白質科学会年会 (2025).
• "MTR4-RNAエキソソーム結合タンパク質SPF30による基質RNA選択とRNA代謝機構への関与"
  田嶋 唯人、小野寺 優花、志田 達哉、泉川 桂一、長浜 正巳
  第25回 日本蛋白質科学会年会 (2025).
• "Tudor domain-containing protein SPF30 regulates telomerase activity by modulating TERC processing via interaction with MTR4-RNA exosome"
  Masami Nagahama, Sotaro Miyao, Maho Nakagawa, Keiichi Izumikawa
  2025 ASBMB Annual Meeting (2025).

  • DOI: 10.1016/j.jbc.2025.109784

Dissertation

• "Functional Regulati on of the WDR74 Module by AAA -AT Pase NV L2 in Pre-rRNA Pro cessi ng"
  Yuya Hirooka
  Dissertation 甲第155号 (2025).

  • URL

2024

Article

• "Pre-ribosomal WDR74 module coordinates the early and late pre-rRNA processing stages for the NVL2-mediated regulation of 60S ribosome biogenesis"
  Hirooka Y, Izumikawa K, Miyao S, Ohga T, Nobe Y, Taoka M, Nagahama M.
  Biochemical and Biophysical Research Communications 744:151175 (2024).

  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2024.151175
• "Mitoribosome structure with cofactors and modifications reveals mechanism of ligand binding and interactions with L1 stalk"
  Singh V, Itoh Y, Del'Olio S, Hassan A, Naschberger A, Flygaard RK, Nobe Y, Izumikawa K, Aibara S, Andréll J, Whitford PC, Barrientos A, Taoka M, Amunts A.
  Nature Communications 15(1):4272. (2024).

  • DOI: 10.1038/s41467-024-48163-x.

Conference (Oral presentation)

• "AAA-ATPase NVL2新規結合タンパク質CWF19L2 のラリアット型 RNA デブランチングにおける機能解析"
  大島 廉太、山崎 隆蔵、泉川 桂一、長浜 正巳
  第23回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2024 (2024).
• "RNA エキソソームのアダプター因子 SPF30 の自己発現制御機構の解析 "
  志田 達哉、泉川 桂一、 宮尾 宗太郎, 杉原 稔、野口 保、長浜 正巳
  第23回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2024 (2024).
• "リボソーム生合成における AAA-ATPase NVL2による WDR74 モジュールの機能的制御 "
  廣岡 侑也、宮尾 宗太郎、泉川 桂一、長浜 正巳
  第23回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム2024 (2024).

Conference (Poster presentation)

• "ラリアット型イントロン脱ブランチ反応におけるNVL2結合タンパク質CWF19L2の機能解析 "
  大島 廉太, 山崎 隆蔵, 泉川 桂一, 長浜 正巳
  第47回 日本分子生物学会年会 (2024).
• "リボソーム生合成関連AAA-ATPase NVL2の欠損が引き起こすリボソーム生合成障害と核小体ストレス応答の誘導 "
  泉川 桂一, 廣岡 侑也, 宮尾 宗太郎, 田村 正則, 元永 沙由里, 長浜 正巳
  第47回 日本分子生物学会年会 (2024).
• "RNAエキソソームアダプタータンパク質SPF30の自己発現制御機構の解析 "
  志田 達哉, 泉川 桂一, 小野寺 優香, 宮尾 宗太郎, 杉原 稔, 野口 保, 長浜 正巳
  第47回 日本分子生物学会年会 (2024).
• "AAA-ATPase NVL2によるWDR74モジュールの分子間相互作用制御を介したrRNA前駆体プロセシングの調節機構 "
  廣岡 侑也, 宮尾 宗太郎, 泉川 桂一, 長浜 正己
  第47回 日本分子生物学会年会 (2024).
• "ジメチル化アルギニン結合タンパク質SPF30とヌクレアーゼ複合体MTR4-RNAエキソソームの相互作用によるH/ACA核内低分子RNAの代謝機構 "
  宮尾 宗太郎, 中川 真秀, 光冨 修平, 尾関 温子, 泉川 桂一, 秋光 信佳, 長浜 正巳
  第144回 日本薬学会年会 (2024).

2023

Article

• "Alzheimer's Disease-Associated Alternative Splicing of CD33 Is Regulated by the HNRNPA Family Proteins"
  Komuro R, Honda Y, Yanaizu M, Nagahama M, Kino Y.
  Cells 12(4):602 (2023).

  • DOI: 10.3390/cells12040602
• "Structure of mitoribosome reveals mechanism of mRNA binding, tRNA interactions with L1 stalk, roles of cofactors and rRNA modifications."
  Singh V, Itoh Y, Del'Olio S, Hassan A, Naschberger A, Flygaard RK, Nobe Y, Izumikawa K, Aibara S, Andréll J, Whitford PC, Barrientos A, Taoka M, Amunts A.
  bioRxiv (Preprint) (2023).

  • DOI: 10.1101/2023.05.24.542018
• "Brucella effectors NyxA and NyxB target SENP3 to modulate the subcellular localisation of nucleolar proteins."
  Louche A, Blanco A, Lacerda TLS, Cancade-Veyre L, Lionnet C, Bergé C, Rolando M, Lembo F, Borg JP, Buchrieser C, Nagahama M, Gérard FCA, Gorvel JP, Gueguen-Chaignon V, Terradot L, Salcedo SP.
  Nature Communications 14(1):102. (2023).

  • DOI: 10.1038/s41467-022-35763-8

Conference (Oral presentation)

• "RNA-MSを用いたRNA修飾解析と疾患関連因子の分子機能解析への応用 "
  泉川 桂一
  第67回 日本薬学会 関東支部大会 シンポジウム「RNA研究が拓く新しい疾患克服へのアプローチ」 (2023).

Dissertation

• "Functional Regulati on of the WDR74 Module by AAA -AT Pase NV L2 in Pre-rRNA Pro cessi ng"
  Sotaro Miyao
  博士論文（薬学） (2023).

  • URL

2022

Article

• "MTR4 adaptor PICT1 functions in two distinct steps during pre-rRNA processing"
  Miyao S, Saito K, Oshima R, Kawahara K, Nagahama M.
  Biochemical and Biophysical Research Communications (2022).

  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2022.11.018
• "MPP6 stimulates both RRP6 and DIS3 to degrade a specified subset of MTR4-sensitive substrates in the human nucleus."
  Fujiwara N, Shigemoto M, Hirayama M, Fujita KI, Seno S, Matsuda H, Nagahama M, Masuda S.
  Nucleic Acids Research 50(15):8779-8806 (2022).

  • DOI: 10.1093/nar/gkac559
• "TDP-43 regulates cholesterol biosynthesis by inhibiting sterol regulatory element-binding protein 2."
  Egawa N, Izumi Y, Suzuki H, Tsuge I, Fujita K, Shimano H, Izumikawa K, Takahashi N, Tsukita K, Enami T, Nakamura M, Watanabe A, Naitoh M, Suzuki S, Seki T, Kobayashi K, Toda T, Kaji R, Takahashi R, Inoue H.
  Scientific Reports 12:7988. (2022).

  • DOI: 10.1038/s41598-022-12133-4

Conference (Oral presentation)

• "核小体 AAA-ATPase NVL2 と結合する SR タンパク質 CWF19L2 のリボソーム 生合成および mRNA スプライシングにおける機能"
  大島 廉太
  第21回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム 2022 (2022).
• "Tudor ドメインタンパク質 SPF30 と MTR4-エキソソームの相互作用による テロメラーゼ RNA 生合成の制御"
  宮尾 宗太郎
  第21回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム 2022 (2022).
• "WDR74 モジュールと MTR4-エキソソームの相互作用およびリボソーム生合成 における機能解析"
  廣岡 侑也
  第21回 次世代を担う若手のためのファーマ・バイオフォーラム 2022 (2022).

2021

Article

• "Interactome analysis of the Tudor domain-containing protein SPF30 which associates with the MTR4-exosome RNA-decay machinery under the regulation of AAA-ATPase NVL2."
  Ishida YI, Miyao S, Saito M, Hiraishi N, Nagahama M.
  The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 132:105919. (2021).

  • DOI: 10.1016/j.biocel.2021.105919

2020

Article

• "Exploration of Salmonella effector mutant strains on MTR4 and RRP6 degradation."
  Sun X, Kawata K, Miki A, Wada Y, Nagahama M, Takaya A, Akimitsu N.
  BioScience Trends 14:255-262. (2020).

  • DOI: 10.5582/bst.2020.03085
• "A cellular model of albumin endocytosis uncovers a link between membrane and nuclear proteins. "
  Urae S, Harita Y, Udagawa T, Ode KL, Nagahama M, Kajiho Y, Kanda S, Saito A, Ueda HR, Nangaku M, Oka A.
  Journal of Cell Science 133:jcs242859. (2020).

  • DOI: 10.1242/jcs.242859
• "Systematic Analysis of Targets of Pumilio-Mediated mRNA Decay Reveals that PUM1 Repression by DNA Damage Activates Translesion Synthesis."
  Yamada T, Imamachi N, Imamura K, Taniue K, Kawamura T, Suzuki Y, Nagahama M, Akimitsu N.
  Cell Reports 31:107542 (2020).

  • DOI: 10.1016/j.celrep.2020.107542